Der Begriff Jugendorganisation ist in Deutschland deckungsgleich mit dem Begriff der Jugendverband. In Deutschland gibt es eine Vielzahl von Jugendverbänden mit unterschiedlichsten Zielsetzungen. In Deutschland haben alle großen Parteien eigene Jugendorganisationen, zum Beispiel gibt es die Junge Union (CDU), die Jungsozialisten (SPD), die Junge Liberale (FDP), die Grüne Jugend (B90/Die Grünen) oder die Linksjugend (Linke). Eine lange Tradition haben auch die Studierendenverbände, die sich meist auch an politischen Orientierungen ausrichten, so gibt es zum Beispiel die Juso-Hochschulgruppen oder die Junge-Union-Hochschulgruppen. In Deutschland gibt es rund 30 weitere politische Jungendorganisationen wie die Deutsche Gewerkschaftsjugend oder die Bundesschülerkonferenz. Traditionell sind auch die Jugendorganisationen der großen Hilfswerke stark in der Jugendarbeit vertreten. Es gibt hier zum Beispiel das Jugendrotkreuz, die DLRG-Jugend, die Johanniter-Jugend, die Wasserwacht-Jugend, das Jugendwerk der AWO oder die Jugendfeuerwehr. In Deutschland und anderen europäischen Ländern haben vor allem auch die Pfadfinderorganisationen eine lange Geschichte. Man kann hier in konfessionelle und interkonfessionelle Organisationen unterscheiden. Zu den konfessionellen Pfadfinderorganisationen gehören zum Beispiel: die Christliche Pfadfinderschaft Deutschlands, die Deutsche Pfadfinderschaft St. Georg, die Katholische Pfadfinderschaft Deutschlands oder der Verband Christlicher Pfadfinderinnen und Pfadfinder, der größten Pfadfinderorganisation der Evangelischen Kirche. Zu den interkonfessionellen Pfadfinderorganisationen gehört zum Beispiel der größte interkonfessionelle Pfadfinderverband, der Bund der Pfadfinder mit rund 30.000 Mitgliedern, der Deutsche Pfadfinderbund oder der Bund Deutscher Pfadfinderinnen.
Zahlreiche Jungenorganisationen sind christliche Jugendorganisationen. Es gibt rund 25 größere christliche Jugendorganisationen, zu denen gehören zum Beispiel: der Bund der Deutschen Katholischen Jugend, die Arbeitsgemeinschaft Evangelischer Jugend, die Kolpingjugend oder die weltgrößte christliche Jugendorganisation, der Christliche Verein Junger Menschen mit weltweit rund 45 Millionen Mitgliedern. Der Young Men’s Christian Association (YMCA) gehören rund 124 nationale Verbände an. Unter anderem gibt es Jugendverbände in Deutschland, Österreich und der Schweiz. Der CVJM-Gesamtverband in Deutschland sitzt in Kassel. Es gibt darüber hinaus auch andere religiöse Jugendverbände wie die Muslimische Jugend Deutschlands oder der Bundesverband Jüdischer Studenten in Deutschland. In Deutschland gibt es traditionell auch große Sportjugendverbände. Größter Träger der freien Kinder- und Jugendhilfe ist die Deutsche Sportjungend. Die Deutsche Sportjugend hat rund 9,5 Millionen Mitglieder in über 90.000 Vereinen. Die Jugendorganisation wurde 1950 in Sudelfeld am Schliersee gegründet. Zu den deutschen Sportjugendverbänden gehört auch die der Deutsche Alpenverein oder die Deutsche Jugendkraft, der katholische Sportverband in Deutschland.
Sehr beliebt sind in den letzten zwanzig Jahren die Umwelt- und Naturschutzjugendverbände geworden. Hierzu zählen zum Beispiel die Jugendorganisation Bund Naturschutz, die Greenpeace-Jugend, die Naturschutzjugend, die BUND-Jugend oder die Sielmanns Natur-Ranger. Zahlreiche Mitglieder haben auch die deutschen Jugendorganisationen in der Wirtschaft. Hierzu zählen zum Beispiel die Wirtschaftsjunioren Deutschlands, der Bundesverband junger Unternehmer oder die Junioren des Handwerks. Ein großer Deutscher Jugendverband ist auch die Bundesvereinigung Deutscher Musikverbände, der rund 1,3 Millionen Mitglieder unter 26 Jahre angehören. Neben den aufgeführten Verbänden gibt es zahlreiche andere Jugendorganisationen in Deutschland, die bestimmte Ziele verfolgen. Hierzu zählt zum Beispiel der Leo-Club (Lions Club), der Bund Deutscher Landjugend oder Rotaract, die Jugendorganisation von Rotary International.